Bölgemizin coğrafi ve iklimsel ve istihdama bağlı iş göçü özellikleri sebebi ile Tropikal hastalıklara açıklığı dikkate alınarak, 1984 yılında Üniversitemizin bilimsel sorumluluk ve bakış açısına sahip değerli yöneticileri tarafından 1984 yılında kurulmuş, kuruluş kararı Ç.Ü Senatosunun 1985 tarih ve.12 sayılı kararı ile kuruluş onanmış, merkez yönetmeliği 1992 yılında resmi gazetede yayınlanarak merkezimize resmiyet kazandırılmıştır.
Kuruluş yıllarında bölgesel önem arz eden sıtma ve sindirim yolu ile bulaşan bazı barsak bakterileri kuruluş gerekçesini oluştururken, günümüzde bölgemizde tarım ve hayvancılıkta yaşanan gelişmeler, bölgede kurulan barajların iklim ve biyolojik faunaya olan etkileri, tarım işçilerindeki hareketliliğe, bölgesel kalkınmaya paralel olarak artan sanayi iş gücü hareketleri ve nihayet komşu ülkelerde yaşanan olumsuzluklara paralel olarak artan dış göç ve temaslar ilgi alanına giren hastalıkları tür ve insidans olarak artırmıştır. Tropikal bölgelerde görülen Hepatit, CMV, EBV, HIV, West Nil Virus, Japon Ensefalit Virus, Kırım Kongo Kanamalı Ateşi, Leptospira, Leishmania, Tüberküloz, Sıtma ve Amibiyazis infeksiyonlar gibi sayıları artırılabilecek çok sayıda infeksiyon hastalığı bölgemiz içinde potansiyel tehdit haline gelmiştir. Bu gün gelinen nokta kuruluş gerekçesindeki haklı öngörüyü ispatlamaktadır.
Her türlü moleküler epidemiyolojik çalışma için uygun donanıma sahip merkezimiz eksiklerini günün şartlarına ve ihtiyaçlarına göre belirleyerek gelişimini sürdürmektedir. Birikim ve imkanlarını bölge ve ülke yararına açan merkezimiz tanı ve epidemiyolojik çalışmaların yanı sıra sempozyum ve kongre gibi bilimsel etkinliklerle sorumluluklarını yerine getirmektedir.
Merkezimiz 1200 m2 kapalı alana sahip olup, 4’ü moleküler düzeyde çalışmaların yapılmasına uygun (Hepa filtreli, negatif basınçlı ve Safe II kabinli) olmak üzere 6 laboratuara sahiptir. Merkez de kuruluşundan bu güne kadar Hastane infeksiyonlarına sebep olan patojenlerin PFGE yöntemi ile sürveyansı, Leishmania, Tüberküloz, Sıtma ve Amibiyazis gibi tropikal ve subtropikal bölgelere has hastalıkların, tanısı, moleküler epidemiyolojisi, vektörlerin belirlenmesi ve tedavileri konusunda sonuçlandırılmış ve devam etmekte olan avrupa birliği, UNDP ve Ç.Ü- BAPKOM (bilimsel araştırma projeleri komisyonu) tarafından desteklenmiş proje çalışmaları yapılmaktadır.
Merkezde moleküler epidemiyoloji amaçlı; Spoligotyping, PFGE, AFLP, PCR-RFLP, SSCP, SDS-PAGE, AP-PCR yöntemlerinin uygulanması konusunda alt yapı ve bilgi birikimi bunun yanı sıra salgına yerinde müdahale, erken ulaşım ve örnek toplama işlemleri transportunda kullanılan kendi üzerine kayıtlı örnek taşımaya uygun olarak dizayn edilmiş, derin donduruculu ve hayvan kafesleri monte edilmiş mobil aracı mevcuttur.